Muzeul de Istorie Naturală din Sibiu este o instituție cu profil muzeal înființată în anul 1849 la Sibiu. Actuala clădire a muzeului a fost construită în anii 1894-1895 în fostul parc al Teatrului, pe strada Cetății nr. 1.
Muzeul de Istorie Naturală este o secție a Muzeului Național Brukenthal și are, la rândul lui, două subsecții:
- Muzeul de Istorie a Farmaciei - aflat în Piața Mică nr. 26
- Muzeul de Vânătoare August von Spiess - situat pe str. Școala de Înot nr. 4
Câțiva intelectuali sași pasionați de cunoașterea naturii au înființat în 1849 la Sibiu Societatea Ardeleană de Științe Naturale (Siebenbürgische Verein für Naturwissenschaften zu Hermannstadt). Scopul societății era să răspândească în rândul comunității descoperirile lor și să educe tânăra generație în spiritul cunoașterii și conservării naturii.
Preocuparea societății a fost canalizată spre formarea unor colecții reprezentative din domeniul științelor naturii. La început, societatea a beneficiat de puține colecții: ierbarul J. Lerchenfeld (alcătuit la sfârșitul secolului al XVIII-lea și care avea 1.811 piese) și ierbarul M. Fuss (alcătuit între 1834-1882, cu aproape 29.000 piese). În cursul secolului al XIX-lea, au fost achiziționate unele colecții de mare importanță cum ar fi colecția ornitologică F.W. Stetter (1853), ce cuprindea 528 păsări indigene și 145 exotice, colecția etnografică din Palestina, Egipt, Sudan și Etiopia a viceconsulului Franz Binder (1824-1875) și colecția de minerale a lui Johann Michael Ackner (1782-1862).